Префектура - территориальный орган исполнительной городской власти, действующая в соответствии с законом и представляющая интересы правительства. Учреждение выполняет контролирующие, координирующие, исполнительно-распорядительные функции. К вопросам, решаемым данной организацией, относятся проблемы землепользования, окружающей среды, градостроительства и др.
Также и префектура Зеленограда, как и другие, является важной административно-территориального организацией округа. Получить консультацию специалистов префектуры Зеленограда можно различными способами. Есть возможность прислать свои вопросы почтой, записаться на личный прием к префекту, отправить вопрос на пейджер префекта, а также воспользоваться интернет-связью, телефонным каналом, задать вопрос при помощи SMS и MMS сообщений. Именно префектурой Зеленограда реализуется целевая программа столицы
«Электронная Москва», разработанная с целью повышения качества жизни горожан, развития демократических институтов; создания благоприятных условий для предпринимательской деятельности, повышения конкурентоспособности организаций города, эффективности городского управления, улучшения работы городского хозяйства и экологии в городе. Забота об оперативном реагировании в случае чрезвычайных ситуаций тоже входит в число обязанностей префектуры Зеленограда, впрочем как и обеспечение безопасности людей с помощью информационно-коммуникационных технологий.
В ВАО столицы соответствующими полномочиями наделена префектура ВАО Москвы, оказывающая поддержку крупным промышленным предприятиям и малому предпринимательству. В целом, префектура ВАО Москвы имеет широкие возможности в финансово-экономической сфере, выступая в роли бюджетополучателя и распределителя бюджетных средств. К тому же, при участии префектуры ВАО Москвы проходит разработка законопроекта о бюджете столицы на финансовый год. Также в перечне обязанностей префектуры ВАО Москвы значатся разработка и утверждение целевых, инвестиционных программ нескольких направленностей. В число этих направлений входят вопросы финансирования реконструкций жилого фонда, привлечение инвестиций в строительные работы, решение жилищных проблем, инвестирование современных технологий и разработка программ, привлекающих денежные средства.